慶余年的秘密是關(guān)于神廟的。神廟是一個(gè)史前人類(lèi)文明的軍事博物館,收藏了幾乎所有的史前人類(lèi)武器。神廟的位置是肖恩知道的,他曾經(jīng)見(jiàn)過(guò)葉輕眉從神廟里出來(lái)。肖恩將這個(gè)秘密告訴了范閑,但葉輕眉要求他不能泄露神廟的位置,因?yàn)樾孤犊赡軙?huì)引發(fā)災(zāi)難。根據(jù)小說(shuō)和電視劇的簡(jiǎn)介,范閑和他的伙伴歷經(jīng)艱險(xiǎn)找到了神廟,發(fā)現(xiàn)神廟實(shí)際上是一個(gè)軍事博物館,保存了史前人類(lèi)的文明和武器。然而,具體神廟內(nèi)部的秘密以及為何肖恩和荷無(wú)法接觸到神廟并沒(méi)有明確說(shuō)明。