慶余年太平別院湖底的秘密是禁忌之門(mén)。葉輕眉在給范閑的信中提到了太平別院湖底存在著禁忌之門(mén),這是一切秘密的最終所在。太平別院是葉輕眉長(zhǎng)期居住的地方,也是慶帝、陳萍萍、范建等人年輕時(shí)的回憶之地。禁忌之門(mén)與范閑有關(guān),與他來(lái)到這個(gè)世界的經(jīng)歷有關(guān)。范閑是上輩子得了絕癥,精神“穿越”到葉輕眉兒子身上的人,這被解釋為上個(gè)文明的一種實(shí)驗(yàn)。禁忌之門(mén)可能是葉輕眉的實(shí)驗(yàn)室,里面可能有現(xiàn)代化的科技設(shè)備,如手機(jī)、導(dǎo)航、電腦等。打開(kāi)禁忌之門(mén)可能會(huì)顛覆秩序,因此葉輕眉警告范閑不要打開(kāi)。除了禁忌之門(mén),太平別院湖底的秘密可能還涉及到葉輕眉如何來(lái)到這個(gè)世界以及她對(duì)其他人的指點(diǎn)等問(wèn)題。