舊地球歷公元3187年，克隆人統(tǒng)治地球后的30年，克隆人歷法新地球克隆歷蟲(chóng)紀(jì)元30年，克隆人已經(jīng)牢牢的控制住了地球的統(tǒng)治權(quán)并將人類的反抗完全的鎮(zhèn)壓，克隆人已經(jīng)完全的收服了月球以及金星、水星、火星等近地行星，人類完全淪為了克隆人的奴隸以及實(shí)驗(yàn)體，但由于克隆人首領(lǐng)主上基因中存在明顯的人格缺陷而造成了現(xiàn)在的他已經(jīng)完完全全地成為了一個(gè)暴君，克隆人內(nèi)部也形成了等級(jí)森嚴(yán)的階級(jí)體制，共分為五大階級(jí)：第一階級(jí)天民圣爾曼、第二等級(jí)上民昆塔莎、第三等級(jí)下民塞斯、第四等級(jí)塵民因紐特，天民與上民是完美的克隆體位于統(tǒng)治地位而下民與塵民由于制造過(guò)程中造成了基因的不完整而只能淪為低等生命體從事著最下賤的工作而且永無(wú)翻身之日，他們的地位只比作為奴隸的人類略強(qiáng)，再進(jìn)行基因變形的調(diào)試時(shí)，天民與上民也往往變形成諸如螳螂、蝎子等位于食物鏈頂端的高等蟲(chóng)類，而下民與塵民卻只能選擇蒼蠅、兵蟻、跳蚤等下級(jí)蟲(chóng)類，更有一群處于完全蟲(chóng)子形態(tài)無(wú)法復(fù)原人類個(gè)體的完全失敗克隆體被丟棄于水星之上，由他們天生的對(duì)于惡劣環(huán)境的抵抗力來(lái)完成即使是作為奴隸的人類都無(wú)法很好完成的任務(wù)，這群人被稱為第五等級(jí)垃圾，久而久之克隆人中下等三民們對(duì)于上等統(tǒng)治者們的積怨也越來(lái)越深。
人類雖然已經(jīng)完全失去了地球乃至半個(gè)太陽(yáng)系的統(tǒng)治權(quán)，但是仍有少部分人類以原始地球地核炙熱的巖漿為保護(hù)傘進(jìn)行著反抗克隆人統(tǒng)治的戰(zhàn)爭(zhēng)，這群人的領(lǐng)袖正是當(dāng)年聯(lián)合國(guó)機(jī)動(dòng)部隊(duì)第五縱隊(duì)隊(duì)長(zhǎng)現(xiàn)年70歲的克里斯，然而現(xiàn)實(shí)是殘酷的，由于上層通知的克隆人有意關(guān)閉了向地下疏通能源的通道，并斷絕了所有地球最底層通向地上的通道而造成這部分人類抵抗軍的生存出現(xiàn)了極大的問(wèn)題，無(wú)奈下克里斯只能下令撤出地球，他們將會(huì)乘坐僅存的傳送艙通過(guò)歷經(jīng)15年建造的且僅能運(yùn)行一次的蟲(chóng)洞大回環(huán)前往太陽(yáng)系的邊界還沒(méi)在克隆人控制之下的冥王星以圖反撲，但運(yùn)行大回環(huán)需要大量的氫能源，由此克里斯派出以扎克、鮑勃以及史巴圖三人組成的小分隊(duì)通過(guò)手工隧道前往地球第三層能源庫(kù)偷取氫能源，為防止意外三人分別做了克隆人偽裝于午夜出發(fā)了。
打開(kāi)秘密隧道出口，扎克首先探出頭來(lái)沒(méi)發(fā)現(xiàn)異常便小心翼翼的爬出隧道向著身后招了招手，隧洞中的鮑勃與史巴圖看到扎克的信號(hào)正準(zhǔn)備向隧道外走卻發(fā)現(xiàn)扎克的手勢(shì)突然變成了“等一下”，兩人迅速停住了腳步并保持身體靜止，隧道外兩名克隆人巡邏兵正向著扎克的方向走來(lái)，而扎克則急中生智的站起身從背后掏出爆能狙擊槍裝作巡邏的樣子，兩名克隆士兵面無(wú)表情的與扎克擦肩而過(guò)，扎克也裝作很堅(jiān)定的堅(jiān)守崗位的樣子，就當(dāng)扎克認(rèn)為危機(jī)解除之時(shí)，克隆巡邏兵隨身的警報(bào)器突然想起，緊跟著兩名克隆人一同回身舉起突擊爆能槍對(duì)準(zhǔn)扎克。
“請(qǐng)亮明身份！”一名克隆巡邏兵完全沒(méi)有抑揚(yáng)頓挫的問(wèn)到。
此時(shí)扎克正疑問(wèn)自己：“哪里出現(xiàn)的破綻，令他們會(huì)發(fā)現(xiàn)自己的身份？”但聽(tīng)到了克隆人的問(wèn)話，扎克不慌不忙的舉起左臂擼起了袖子顯露出位于左臂上的身份碼，克隆巡邏兵中的一人來(lái)到扎克面前打開(kāi)掃描儀對(duì)扎克的身份碼進(jìn)行掃描并沒(méi)有發(fā)出發(fā)現(xiàn)異常而報(bào)警的聲音，扎克長(zhǎng)吐了一口氣，但克隆巡邏兵手中的武器突然發(fā)出警報(bào)并大叫著：“非法武器，非法武器……”，兩名士兵立即對(duì)著扎克展開(kāi)射擊，扎克趕忙就地翻滾躲避射擊并順勢(shì)舉起手中的爆能槍準(zhǔn)備還擊卻發(fā)現(xiàn)鮑勃與史巴圖已經(jīng)在身后制服了克隆士兵，扎克站起身看了看自己的槍想了想說(shuō)：“克里斯指揮官的預(yù)測(cè)是對(duì)的，我們必須要離開(kāi)地球了，我們已經(jīng)無(wú)法通過(guò)偽裝來(lái)騙過(guò)克隆人的眼睛了?！笔钒蛨D撿起兩支克隆人巡邏兵的槍將其中一支遞給了鮑勃說(shuō)：“眼下應(yīng)該不會(huì)礙事了！”
“這槍是卡洛斯大叔的那支？”鮑勃突然看到了扎克手中的狙擊槍問(wèn)到，扎克點(diǎn)點(diǎn)頭回答：“是師父的！”
“看來(lái)，他認(rèn)為你徹底的出徒了！”鮑勃開(kāi)著玩笑，扎克笑著回答：“希望如此吧！”
“不過(guò)眼下咱們必須要想好如何讓它通過(guò)克隆人的眼睛！”史巴圖指了指扎克的狙擊槍，鮑勃笑了笑說(shuō)：“好辦，由他遠(yuǎn)程掩護(hù)！”聽(tīng)了這話史巴圖點(diǎn)點(diǎn)頭說(shuō)：“就這樣將計(jì)就計(jì)了！”扎克看了看自己的槍想要說(shuō)什么可又將話咽了下去而換做點(diǎn)點(diǎn)頭。
一處懸浮燈塔，扎克利用蟲(chóng)洞來(lái)到它的頂棚之上，掏出狙擊槍趴好向著地面上的鮑勃與史巴圖揮了揮手，意思是自己已經(jīng)準(zhǔn)備就緒。
地面上的兩人看見(jiàn)了扎克的信號(hào)貓著腰小心翼翼的摸索著來(lái)到了重兵把守的儲(chǔ)存了大量原始?xì)浒舻哪芰抠A藏庫(kù)，只見(jiàn)此時(shí)在倉(cāng)庫(kù)外雖不見(jiàn)幾名克隆士兵，但利用先進(jìn)的機(jī)械與光能系統(tǒng)已然將它來(lái)了個(gè)全方位立體防護(hù)，不過(guò)鮑勃與史巴圖既然是來(lái)盜取氫棒的那么就一定會(huì)有應(yīng)對(duì)的方法，兩人首先就近找到了一處下水道入口趁看守不備鉆入其中，由于是防守重鎮(zhèn)即使是下水道也被布置了嚴(yán)密的防護(hù)，縱橫交錯(cuò)的光能防護(hù)網(wǎng)就連一只蒼蠅都飛不進(jìn)去，一旦有異物觸碰到光能線便會(huì)被直接割碎，然而兩人利用特制的鏡子卻輕而易舉得便穿過(guò)了光能防護(hù)網(wǎng)直接不費(fèi)吹灰之力的進(jìn)入了貯藏庫(kù)房，鮑勃打開(kāi)手腕上的虛擬顯示計(jì)時(shí)器將時(shí)間調(diào)整為30秒倒計(jì)時(shí)對(duì)著史巴圖打出OK的手勢(shì)，史巴圖隨即打開(kāi)微型蟲(chóng)洞依次將面前的氫棒逐一順入蟲(chóng)洞，很快30秒倒計(jì)時(shí)所剩無(wú)幾，鮑勃趕忙向史巴圖打出關(guān)閉蟲(chóng)洞的手勢(shì)，史巴圖隨即關(guān)閉。鮑勃的手表緊跟著是10秒倒計(jì)時(shí)，很快數(shù)字走過(guò)又轉(zhuǎn)換為30秒倒計(jì)時(shí)，史巴圖再次打開(kāi)蟲(chóng)洞又迅速的逐一向蟲(chóng)洞中順入氫棒，就這樣交替開(kāi)啟與關(guān)閉蟲(chóng)洞很快半屋子的氫棒被送入蟲(chóng)洞，看著如此多的能源棒被送往人類反抗軍的基地，史巴圖與鮑勃越來(lái)越興奮，興奮地已然忘記30秒的倒計(jì)時(shí)，蟲(chóng)洞的打開(kāi)時(shí)間剛超過(guò)5秒頓時(shí)其散發(fā)的能量場(chǎng)引發(fā)了能量倉(cāng)庫(kù)防護(hù)網(wǎng)的感知警報(bào)聲立即四起，霎時(shí)間大量的克隆人士兵以及大量的防護(hù)機(jī)器人涌向倉(cāng)庫(kù)。
趴在懸浮燈塔之上扎克大叫“不好”，立即將爆能狙擊槍的能量推到最大對(duì)著克隆人最集中的地方就是一槍直接便在其中爆炸開(kāi)來(lái)，克隆人士兵一時(shí)間死傷無(wú)數(shù)，防護(hù)機(jī)器人也被炸掉不少，一部分士兵趕忙掉頭在防護(hù)機(jī)器人的指引下發(fā)現(xiàn)了扎克，對(duì)著他便是亂槍掃射，扎克趕忙翻身躲閃，由于燈塔之上的地方太小令他直接翻落而下，在空中扎克趕忙打開(kāi)蟲(chóng)洞是自己掉入蟲(chóng)洞之中隨即蟲(chóng)洞關(guān)閉。正當(dāng)追擊扎克的克隆人與機(jī)器衛(wèi)兵四處尋找他之時(shí)，在士兵們身后，圍向能量?jī)?chǔ)藏倉(cāng)庫(kù)的士兵之前扎克的蟲(chóng)洞突然打開(kāi)，躍出蟲(chóng)洞的扎克扔出了全身攜帶的所有手榴彈隨后又跳入蟲(chóng)洞，隨著手榴彈的爆炸再次掀翻大量的士兵與機(jī)器衛(wèi)兵，追擊扎克的克隆人士兵們趕忙調(diào)轉(zhuǎn)槍口哪知史巴圖與鮑勃突然從他們身后迅速打開(kāi)的蟲(chóng)洞中殺了出來(lái)，一通掃射再被被擊斃擊傷無(wú)數(shù)，雖然略占上風(fēng)但此時(shí)鮑勃等的蟲(chóng)洞卻被機(jī)器衛(wèi)兵擊中發(fā)生爆炸導(dǎo)致他手腕上的蟲(chóng)洞手表也隨之爆炸，鮑勃的手腕瞬間被炸傷。
同伴被炸傷，自己的子彈數(shù)量又嚴(yán)重不足，史巴圖掏出基因變形血清便注入到了自己的頸動(dòng)脈瞬間變形成大型棕熊類生物殺向克隆人士兵群，警覺(jué)的克隆人們直接自由變形為大齒猛蟻群，向史巴圖展開(kāi)圍攻，棕熊史巴圖雖然力量強(qiáng)大但終究好狗架不住群狼在蟻群的攻擊下而漸漸敗落下風(fēng)，就在這危急關(guān)頭他的頭頂突然打開(kāi)一道蟲(chóng)洞，正處于向著蝙蝠變形過(guò)程中的扎克沖出了蟲(chóng)洞，兩只后爪緊緊抓住史巴圖與鮑勃的手臂使勁一扯將他們帶到了空中，又使勁一甩將他們先后甩向遠(yuǎn)處，同時(shí)打開(kāi)蟲(chóng)洞讓史巴圖與鮑勃直接摔進(jìn)蟲(chóng)洞，不遠(yuǎn)處另一群克隆人士兵直接變形成了帶翅膀的飛螞蟻撲向扎克，扎克在關(guān)閉蟲(chóng)洞之后再轉(zhuǎn)身應(yīng)付飛螞蟻群可為時(shí)已晚，他直接被飛螞蟻們撲落在地，隨即被天空中與地面上的螞蟻群死死的困住，起初蝙蝠扎克還著手還擊，十?dāng)?shù)只螞蟻應(yīng)聲斃命，但很快他便寡不敵眾起來(lái)，逐漸淹沒(méi)在螞蟻群當(dāng)中。