自建武元年（25年）至建武六年（30年）初，劉秀經(jīng)過將近六年的東征西討，劉秀已經(jīng)基本上控制了除隴右和巴蜀之外的廣大中原之地，基本上統(tǒng)一了中國的東方，與西北隴右的隗囂、西南巴蜀的公孫述形成了鼎足之勢。
建武六年（30年）四月，光武帝至長安，告訴隗囂他將派譴建威大將軍耿弇等七將軍從隴西攻蜀。但隗囂堅絕反對，并派大將王元率兵據(jù)守隴坻（今陜西隴縣西北），伐市塞道阻止?jié)h軍進攻。
四月，漢軍沿渭北平原翻隴山仰攻隴坻，但結(jié)果大敗，兵士死傷眾多。王元看后便跟蹤追擊，幸好有馬武率精騎斷后，使?jié)h軍得以后撤平安歸來。劉秀留耿弇駐守漆縣（今陜西彬縣），馮異駐守栒邑（今陜西旬邑東北），祭遵駐守沂縣（今陜西隴縣南），又另調(diào)吳漢由洛陽西進，在長安集結(jié)其所能動用的兵力。
隗囂乘勝派行巡進攻栒邑，王元攻取肝縣，均被耿弇，馮異兩人所擊敗。(從此點來看，他們二人善守而不善攻。)
時割據(jù)河西的竇融已經(jīng)歸附劉秀了，進攻金城（今甘肅蘭州市西北）時，擊破助隗囂的羌族豪強何封等部，隗囂腹背受敵。隗囂大將馬援也在隗囂反漢時便已經(jīng)歸附于漢。光武帝劉秀給他精騎五千，招降隗囂部屬和羌族豪長，從內(nèi)部開始分化瓦解隗囂。
隗囂于是上書劉秀表示親善，企圖以此作為緩兵之計，未遂。即派出使者向公孫述稱臣。建武七年（31年）春，公孫述立隗囂為朔寧王，出兵援隴。
秋，隗囂親自率領(lǐng)步騎三萬進攻安定郡（郡治高平，今寧夏固原），進至陰架（今甘肅涇川東）。另又派譴部隊去進攻肝縣，企圖奪取關(guān)中，馮異、祭遵分別將其擊敗。
次年春，劉秀派表兄來歙率軍二千，秘密從番須、回中，襲占略陽，威脅隗囂所占據(jù)的冀縣。
隗囂集中精銳，反攻略陽數(shù)月未克。閏四月，劉秀利用隗囂頓兵堅城、士卒疲憊之機，進兵高平第一城，竇融也率河西步騎數(shù)萬前來會師。漢軍分路挺進隴山，招降瓦亭守將牛邯等隗囂大將十三人。屬縣十六、軍隊十余萬皆降，略陽圍解。隗囂大敗只能率殘部逃奔西城。
漢軍占領(lǐng)天水郡。適值農(nóng)民軍余部復起，京師騷動，劉秀趕回洛陽。同年十一月，岑彭水灌西城時，隗囂部將王元、行巡、周宗率蜀援軍五千人趕到，從高地反擊，漢軍被打了個措手不及，王元等突入西城，迎隗囂入冀。
此時漢軍補給困難，糧食已盡，各部被迫出隴西。隗囂收拾殘部，一時又奪占隴西數(shù)郡。九年正月，隗囂死。部眾擁立其少子隗純?yōu)橥酢?p> 建武八年（32年）八月，耿弇、寇恂攻破高平第一城。十月，來歙、蓋延又攻破落門，王元只身逃奔去公孫述，隗純等人投降。此戰(zhàn)，歷時4年，之后隴西始平定，歸東漢統(tǒng)治。